NFMP的天然林管理（NFM）部份主要负责两方面的工作：天然林的规划和实际管理。

其“规划”中有许多相关的活动，包括：

★ 多资源森林清查
★ 森林功能制图（区划与分类）
★ 生态系统建模
★ 土地利用规划
★ 乡级战略性森林经营规划
★ 村级森林作业设计
★ 制定天然林区共管机构安排计划

“实际管理”则主要包括以下活动：

★ 天然林的营林管理
★ 改善竹子和非林木产品管理
★ 边界调查
★ 共管规划和机制的实施

天然林管理部分与多位中欧专家及国家林业局的技术专家密切合作，对改进的方法进行创新、试验和验证，从而找出“最佳经验”，为国家林业局今后在比更广泛的区域内推广打下坚实的基础。

天然林管理活动类型：

★ 制定和完善天然林资源开发、恢复和采伐的管理技能；
★ 制定和试验新的规划程序；
★ 对试验过的活动进行示范（规划、管理、营林）；
★ 在操作实验中，培训林业工作人员和相关利益者。